D'où vient donc l'étrange attirance de ces régions polaires, si puissante, si tenace qu'après en être revenu, on oublie les fatigues morales et physiques pour ne songer qu'à retourner vers elles ? D'où vient le charme inouï de ces contrées pourtant désertes et terrifiantes ? ainsi s'exprime Charcot en février 1905.

Dès 1906, l'idée de Charcot, c'est de repartir pour approfondir les travaux effectués avec le Français au travers d'une nouvelle expédition française de grande envergure.

En septembre 1907, la construction du Pourquoi-Pas ? est officiellement lancée aux Chantiers Gautier de Saint-Malo.

Ce second bateau polaire, plus grand et plus puissant que le Français est un trois-mâts barque à machine auxiliaire dont les aménagements intérieurs comportent trois laboratoires et une bibliothèque.

Cette expédition antarctique comporte un hivernage à l'île Petermann jusqu'en novembre 1909 dans une anse trouvée le 1er janvier 1909 et dénommée Port-Circoncision en souvenir du grand navigateur français Bouvet de Lozier qui avait baptisé ainsi l'île qu'il avait découverte le 1er janvier 1739.

Malgré la lassitude de l'hivernage et les avaries du navire, la campagne d'été finale est fertile en résultats et en découvertes nouvelles. Le 11 janvier 1910, on a dépassé la latitude extrême atteinte jusqu'ici dans ces parages. La Terre Alexandre 1er se montre sous un angle nouveau qui permet d'en améliorer le tracé. Puis, découvrant une terre inconnue qui reçoit le nom de Charcot en hommage à son père, Charcot reprend sa route vers l'ouest à la lisière de la banquise, se faufilant dans la brume au milieu des icebergs.